Zipacón actualmente no cuenta con un centro médico dentro del municipio, los habitantes tienen que redirigirse a los centros médicos de Facatativá o Mosquera para realizar sus chequeos ó para una revisión por enfermedad. Esta recomendación de política pública, busca la garantía digna de acceso a la salud para todos los habitantes del municipio.
Según un estudio realizado por el DNP (Departamento Nacional de Planeación), en donde indica la brecha entre municipios en temas como: salud, educación, vivienda, acueducto e institucional; indica que Zipacón no ha realizado esfuerzos por superar los déficit que tienen.